تأسست أكاديمية الإمارات للهوية والجنسية لأول مرة تحت اسم معهد الإمارات للجنسية والإقامة والمنافذ في عام 2008، كانت مهمتها العمل كمعهد تدريب مهني متخصص في مجال شؤون الجنسية والإقامة وأمن المنافذ . أصبحت الأكاديمية من مؤسسات التعليم العالي في عام 2012 بعد حصولها على الترخيص كمؤسسة تعليم عالي من وزارة التربية والتعليم من خلال إجراءات مفوضية الاعتماد الأكاديمي. وقد حصلت برامجها على الاعتماد الأولي في عام 2014. وفي أعقاب صدور المرسوم الإداري بموجب القانون الاتحادي رقم (2) لسنة 2004 وتعديلاته، ولائحة مجلس الوزراء رقم (7) لسنة 2018، أصبحت الأكاديمية إحدى إدارات الهيئة الاتحادية للهوية والجنسية، وأُعيد تسميتها باسم أكاديمية الإمارات للهوية والجنسية. و تطرح الان الأكاديمية عدد من التخصصات مثل دبلوم الاقامة و الجنسية و المنافذ بكالوريس أدارة الهوية و العلوم الأمنية تضم الأكاديمية أعضاء هيئة تدريس على مستوى عالٍ من التأهيل ويتمتعون بخبرة علمية وعملية في مجالات الهوية والجنسية والإقامة وشؤون الأمن الوطني. كما تساعد البرامج الشاملة التي توفرها الأكاديمية بما فيها المساقات النظرية والعملية وبناء القدرات الموارد البشرية في رفع مستوياتها التعليمية والمهارات المهنية التي تساهم بكل قوة في التنمية المستدامة للخدمات الأمنية ورفاهية المجتمع المحلي والدولي. و تدعم الأكاديمية البحث العلمي حيث أًصدرت مجلة علمية متخصصه ، و شاركت في العديد من المؤتمرات العلمية المحلية و الدولية.